原生动物门可按下述方式分类：质走亚门鞭毛虫纲植鞭亚纲金滴虫目隐滴虫目植滴虫目眼虫目腰鞭目绿滴虫目动鞭亚纲根鞭目原鞭目多鞭目超鞭目领鞭毛目曲滴虫目双滴虫目毛滴虫目肉足纲（根足纲）根足亚纲变形目有壳目有孔目幅足亚纲太阳目放射目孢子虫纲晚孢子亚纲簇虫目球虫目血孢子目无丝孢子亚纲肉孢子目丝孢子亚纲胶孢子目放射孢子目微孢子目纤毛亚门纤毛纲原纤毛亚纲真纤毛亚纲全毛目旋唇目漏斗目缘毛目吸管纲常见的原生动物阿米巴原虫
海洋原生动物的种类
原生动物种数繁多，数量巨大。已知有65000多种，现生种约占一半，其中多数为海洋种类。按传统观点，原生动物是一个门。1980年国际原生动物学家协会的分类和进化委员会将原生动物提为亚界，下分 7个门。有的学者还根据生物体内某些蛋白质的氨基酸成分，对一些原生动物进行分类。海洋原生动物的主要类群为有孔虫(Foraminifera)、放射虫(Radiolaria)、腰鞭毛虫(Dinoflagellata)、丁丁虫(Tintinnida)和硅质鞭毛虫(Silicoflagellata)。 一般具自身分泌的特丁质(tectin)、钙质或硅质外壳，亦可胶结外界的物质形成外壳。壳由单房室或多房室组成，壳体一般小于 1毫米，极少数可达数厘米。颗粒状的粒网伪足从口孔或壁孔伸出，经反复分枝、愈合，形成网状，有运动、摄食、消化和建造外壳等作用。主要食物为硅藻，亦兼食其他有机物（如菌类、植鞭毛藻、纤毛虫、甲壳类幼虫和线虫等），个别种摄食砂粒。它们也被其他生物所食，因而成为海洋食物链的一个环节。有孔虫的生殖方式有无性生殖和有性生殖两种。有性生殖的种类，一般具有类似低等植物的世代交替现象，即无性的双倍体世代与有性的单倍体世代交替。这种特殊的世代交替生殖方式有别于所有其他动物的世代交替方式。生殖后的母体，原生质耗尽，生命终止，仅剩空壳。有孔虫主要生活于正常海洋环境,分布甚广,从潮间带到深海盆，从北极到南极海域都有。大多数种类（约4000多种）生活在海底沉积物表层至数厘米内，少数固着于海草或其他物体上生活，统称为底栖有孔虫。它们的种类和数量，在水深不超过 200米的陆架区最多，迤向深海递减。它们对环境的反应相当敏感，不少种有明显的深度分布范围，根据它们的分布趋势可以划出各个不同的深度带，因而有孔虫是很好的海深指示生物。少数种类（约40种）随海流移动，称为浮游有孔虫。它们绝大多数出现于正常盐度的大洋中，少数几种能生存在盐度较低的海水中。一般说，它们的数量随深度而增多。大洋中数量尤多，其沉降到海底的空壳要占沉积物的30%以上，组成有孔虫软泥，是海洋沉积生物中最重要的组成部分。根据对温度的适应性，有孔虫可分暖水种和冷水种两大类群。南、北极海域有3～4个冷水种，数量最多的为厚壳方球虫(Globoquadrina pachyderma)和泡抱球虫(Globigerina bulloides)两个种， 它们的数量向低纬度递减；在热带亚热带海域数量多的种类有敏纳圆辐虫(Globorotilia menardii)、 袋拟抱球虫(Globigeri-noides sacculifer)等，其数量向高纬度递减以至绝迹。根据各类有孔虫出现数量最多的区域，可将世界大洋的浮游有孔虫划分为 5个组合。这些组合的界线与地球的温度带界线和大洋环流的界线基本吻合。有孔虫从寒武纪（距今5.7亿年前～5亿年前）到现代均有发现,历时5亿多年，已记载的约有34000多种,占已知原生动物种数的半数以上。其中现生的约有4600种，如抱环虫(Spiroloculina)、编织虫 (Textularia)、企虫(Elphidium)（图1）。 大小由数微米到数厘米，单体或群体，常呈球状。细胞质由囊膜分为内、外两部分，囊膜上有穿孔，细胞质可由孔中通过。囊内有内质、细胞核、油滴、结晶体和凝块，以及共生的虫黄藻；囊外为外质层，有各种形状的伪足（如粒网伪足和轴足）。某些种类还有肌纤丝，可使身体膨胀或收缩，以在水中沉浮。绝大部分放射虫都有骨骼，骨骼形式繁多，有放射形、同心形、介壳形以及其他形状。骨骼结构的形式是放射虫分类的重要依据。除等幅骨虫的骨骼是由硫酸锶或由钙铝的硅酸盐组成外，大部分都是硅质。放射虫仅生活于海洋，为大洋性浮游生物，遍布世界各个海域的不同深度，大多数分布在热带海区和大洋环流中。大部分种类分布在离岸较远的海域，愈接近黑潮和湾流区，种类和数量愈多；近岸分布很少，甚至没有。中国沿海有 400多种，如四门孔虫(Tetrapyle)(图2)。放射虫的现生种与化石种现记录共约7180种，分为等幅骨虫类、多囊虫类、稀孔虫类和捧矛虫类。在原生动物中，其数量仅次于有孔虫，死亡后的残骸沉降到海底形成放射虫软泥等。 体表遍生细纤短毛，靠纤毛的波动得以运动。具一铠壳，壳为胶质，除用来保护身体柔软组织外，还可作为浮游器官，并在移动时指引方向。运动时口端向后，类似枪乌贼那样。个体大小可由20微米到1000微米，通常在100～200微米之间。已知约有1200种，现生种为 840种，其中海洋种类约占40%，如类铃虫(Codo-nellopsis)。丁丁虫是海洋微型浮游动物的一个主要成员，可生活在各大洋和沿海水域，绝大部分种类栖息在真光层上部。它们以细菌、藻类、腰鞭毛虫和小型纤毛虫为食，又是较大的浮游动物（如被囊类）的饵料。硅质鞭毛虫 为海洋浮游生物中分泌硅质骨骼的小鞭毛虫类。个体小，直径一般为20～50微米。具黄绿色的色素体，能营光合作用，属自养生物，因而植物学家将其列入藻类，称为硅鞭藻。体内有一无色圆形至卵圆形的细胞核，原生质透明清晰。外层中骨骼弯角处伸出伪足，虫体前端伸出单根鞭毛。骨骼一般为小管状，呈放射对称。现生约有58种，如格棘虫(Dictyocha)（图4）。
